用于虚拟筛选的商业化合物精选数据库,包含数百万种可直接采购的分子。
请调用 `zinc-database` 技能筛选符合特定子结构要求的小分子以进行分子对接。
用于高效存储和操作大规模分块、压缩、N 维数组数据的 Python 库。
请调用 `zarr-python` 技能读取该分块存储的云端观测数据集。
访问美国专利商标局数据库,检索专利申请、授权及法律状态信息。
请调用 `uspto-database` 技能查询关于该生物技术的相关专利。
包含蛋白质序列、功能注释及病理关联信息的权威性生物数据库。
请调用 `uniprot-database` 技能检索该蛋白的酶活性和亚细胞定位信息。
基于 PyTorch 的图神经网络 (GNN) 库,用于处理图结构和不规则数据。
请调用 `torch_geometric` 技能实现一个图卷积网络 (GCN) 模型。
为开发者构建自定义新技能提供参考规范和代码模板。
请调用 `template-skill` 技能协助我规划新技能的项目结构。
涵盖已知及预测的蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 的综合数据库。
请调用 `string-database` 技能构建并分析该蛋白质的相互作用网络。
用于发现、探索和共享各种自定义科学技能的综合工具库。
请调用 `skill-share` 技能为我推荐一些适用于分子建模的技能。
同行评审的人类生物学通路数据库,包含分子水平上的反应机理和可视化图表。
请调用 `reactome-database` 技能查询该蛋白质涉及的信号传导通路。
由美国国立医学图书馆提供的超过 3600 万条生物医学文献摘要及索引。
请调用 `pubmed-database` 技能搜索关于该疾病的最新临床报告。
全球最大的化合物数据库,包含分子的物理属性、毒性及生物活性数据。
请调用 `pubchem-database` 技能查询该分子的 CID 和 2D 结构。
用于从 protocols.io 平台检索、管理及共享实验方法和协议的工具。
请调用 `protocolsio-integration` 技能查找该实验的标准操作步骤。
全球唯一的生物大分子(蛋白质、核酸)三维结构实验数据公开库。
请调用 `pdb-database` 技能下载该蛋白质的晶体结构文件。
集成人类遗传学和多组学数据,用于药物靶点识别与验证的公共平台。
请调用 `opentargets-database` 技能查询与该遗传疾病关联度最高的靶点。
一个完全开放的全球学术实体图谱,涵盖数亿篇论文、作者及机构。
请调用 `openalex-database` 技能查询该领域影响力前五的学者。
用于处理高密度 Web 数据和科学文献信息的综合检索工具。
请调用 `offer-k-dense-web` 技能从高密度网页中提取核心科学数据。
用于科学计算、矩阵运算、信号处理和建模的数值计算环境。
请调用 `matlab` 技能编写一个用于信号滤波的脚本。
用于从 LangSmith 平台抓取追踪数据以优化大模型表现的工具。
请调用 `langsmith-fetch` 技能获取最近的模型运行记录。
集成 LabArchive 平台,实现电子实验笔记的自动化管理与数据同步。
请调用 `labarchive-integration` 技能在我的电子笔记中新建一个实验条目。
整合多个来源的基因信息和功能注释,提供统一的查询接口。
请调用 `gene-database` 技能查询该基因的生物学通路信息。
用于系统发育树(进化树)构建、分析及可视化的 Python 框架。
请调用 `etetoolkit` 技能绘制并渲染该 Newick 格式的进化树。
用于蛋白质序列分析、结构预测和变异效应评估的演化规模语言模型。
请调用 `esm` 技能提取该蛋白质序列的特征向量。
为科研项目自动生成技能说明文档及其索引。
请调用 `document-skills` 技能为本项目中的所有自定义技能生成文档。
分析开源科研软件的开发者活跃度及社区生态增长情况。
请调用 `developer-growth-analysis` 技能分析该 GitHub 项目的贡献者增长趋势。
编程式访问 DataCommons 知识图谱,用于获取公共统计数据和科学事实。
请调用 `datacommons-client` 技能查询特定地区的人口与经济统计数据。
实验室数据生态系统内的应用程序集成工具,用于优化科研工作流。
请调用 `connect-apps` 技能打通这两个实验分析工具之间的数据流。
用于实验室数据连接、集成及跨平台互通的综合工具和资源。
请调用 `connect` 技能协助我整合各实验设备的输出数据。
用于设计、操作和优化嘈杂中型量子 (NISQ) 计算机上量子线路的 Python 库。
请调用 `cirq` 技能编写一段量子门控操作脚本。
为科研项目或软件工程自动生成标准的更新日志。
请调用 `changelog-generator` 技能根据最近的提交记录生成更新日志。
用于检索和获取 BioRxiv 预印本论文的工具和资源。
请调用 `biorxiv-database` 技能搜索该领域的最新预印本论文。
包含假设检验、效能分析及实验设计的综合统计分析工具。
请调用 `statistical-analysis` 技能分析该组数据的显著性差异。
遵循 IMRAD 格式的论文写作工具包,涵盖引证管理及核心写作原则。
请调用 `scientific-writing` 技能协助我完成论文的方法论章节。
生成符合期刊发表要求的科学图表,包含自动置信区间及调色板配置。
请调用 `scientific-visualization` 技能为该数据集绘制符合 CNS 标准的图表。
用于严密科学推理、评估论证逻辑和识别偏差的工具。
请调用 `scientific-critical-thinking` 技能分析该实验结论的潜在漏洞。
用于激发科研灵感、探讨跨学科关联和挑战既有假设的创意伙伴。
请调用 `scientific-brainstorming` 技能协助我探讨该实验的改进方案。
跨学科的系统性科研评审工具,涵盖方法论、统计学及伦理评估。
请调用 `peer-review` 技能协助我评阅这篇学术论文。
支持多数据库检索(PubMed, bioRxiv)和多种引用格式的系统性文献综述工具包。
请调用 `literature-review` 技能总结关于该话题的最新研究进展。
用于系统性生成和评估科学假设的结构化框架。
请调用 `hypothesis-generation` 技能针对该领域提出新的研究课题。
包含自动化统计、可视化和见解提取的综合探索性数据分析工具包。
请调用 `exploratory-data-analysis` 技能对该数据集进行自动化 EDA 分析。
用于准备医疗器械质量管理体系 (QMS) 的 ISO 13485 认证文档工具包。
请调用 `iso-13485-certification` 技能协助我起草医疗器械质量手册。
应用 ScholarEval 框架对学术论文和科研成果进行系统性评价。
请调用 `scholar-evaluation` 技能评估该篇论文的创新性和影响力。
使用 Perplexity Sonar Pro 模型调研特定领域的最新科研动态。
请调用 `research-lookup` 技能查询关于 CRIPSR 技术的最新进展。
协助为 NSF, NIH, DARPA 等机构撰写具有竞争力的科研基金申请书。
请调用 `research-grants` 技能协助我起草一份 NIH 的基金申请书。
检测当前可用的 CPU/GPU 算力资源并生成科学计算任务建议。
请在开始重型计算前调用 `get-available-resources` 技能检查系统状态。
硬件无关的纯 Python SDK,用于控制自动化实验硬件和液体处理系统。
请调用 `pylabrobot` 技能编写一段自动移液控制脚本。
支持将 20 多种文件格式转换为最适合 AI 处理的 Markdown 文本。
请调用 `markitdown` 技能将该 PDF 文档转为 Markdown 格式。
获取主流期刊(Nature, Science)及学术会议的 LaTeX 模板和投稿指南。
请调用 `venue-templates` 技能查找 Nature 杂志的投稿模板。
使用 PowerPoint 和 LaTeX Beamer 构建用于学术报告的演示文稿。
请调用 `scientific-slides` 技能协助我制作一组学术汇报幻灯片。
使用 AI 智能迭代生成出版质量的科学图表和原理图。
请调用 `scientific-schematics` 技能为我的论文设计一个实验流程图。
为偏好“所见即所得”工具的研究者提供 PowerPoint 格式的学术海报制作。
请调用 `pptx-posters` 技能协助我制作一张 PowerPoint 格式的海报。
基于 Perplexity 模型的实时联网搜索,提供带有来源引用的准确答案。
请调用 `perplexity-search` 技能查询该领域的最新研究进展。
将学术论文自动转化为多种推广格式和网页内容。
请调用 `paper-2-web` 技能将我的最新论文转化为一个宣传网页。
生成顶级咨询公司风格的详尽市场调研报告(50页以上)。
请调用 `market-research-reports` 技能为我生成一份关于合成生物学的市场调研报告。
使用 LaTeX (beamerposter/tikzposter) 制作专业的学术会议海报。
请调用 `latex-posters` 技能协助我排版这张学术会议海报。
为科学插图、原理示意图和可视化分析生成并编辑 AI 图像。
请调用 `generate-image` 技能生成一张细胞内部结构的示意图。
学术研究的全面引用管理,支持多种格式校准与文献管理。
请调用 `citation-management` 技能将这些参考文献转换为 APA 格式。
利用大语言模型自动生成并测试科学假设,加速科研发现进程。
请调用 `hypogenic` 技能针对该实验现象提出三个可能的科学假设。
自动执行从数据分析到论文发表的完整研究工作流的多代理系统。
请调用 `denario` 技能协助我完成从实验数据到论文初稿的整理。
斯坦福 SNAP 实验室开发的自主生物医学 AI 代理框架,可跨领域执行复杂科研任务。
请调用 `biomni` 技能为我策划一个关于阿尔兹海默症的药物发现方案。
用于生物信息学的 Python 库,提供序列分析、分级聚类和多样性指标计算等功能。
请调用 `scikit-bio` 技能计算该样本群落的 Shannon 指数。
用于读写和处理流式细胞术标准格式 (FCS) 文件的 Python 库。
请调用 `flowio` 技能读取该 FCS 文件并提取元数据。
用于探索和可视化次世代测序 (NGS) 数据(如 ChIP-seq, RNA-seq)的工具包。
请调用 `deeptools` 技能为这些 BigWig 文件生成热图和指纹图。
采用延迟计算技术处理并可视化超大规模(亿级)表格数据的 Python 库。
请调用 `vaex` 技能统计该 100GB HDF5 文件的特征分布。
用于代数运算、微积分等精确符号数学计算的 Python 库。
请调用 `sympy` 技能求解该函数的导数并化简表达式。
基于进程的离散事件仿真框架,适用于建模排队系统、物流和生产流程。
请调用 `simpy` 技能模拟一个银行排队服务系统的运作过程。
基于 Matplotlib 的高级统计制图库,提供精美的主题和简洁的接口。
请调用 `seaborn` 技能绘制该多维数据集的热力图和回归曲线。
支持 40 多种图表类型的交互式科学与统计数据可视化库。
请调用 `plotly` 技能绘制一个交互式的 3D 散点图。
基于 Rust 编写的高性能数据框库,提供极速的数据处理能力。
请调用 `polars` 技能对该千万级数据集执行分组聚合操作。
用于研究复杂网络结构、动力学及其功能的 Python 库。
请调用 `networkx` 技能计算该社交网络图的中心度指标。
Python 最基础的绘图库,用于创建高质量的静态、动态和交互式图表。
请调用 `matplotlib` 技能绘制该函数的折线图并添加标注。
扩展了 pandas 以支持地理空间矢量数据(如 Shapefile、GeoJSON)操作的库。
请调用 `geopandas` 技能读取该 Shapefile 文件并绘制地图投影。
用于大规模数据集并行计算的 Python 库,支持分布式数组和 DataFrame。
请调用 `dask` 技能处理这个超出单机内存的 CSV 数据集。
用于高性能计算流体动力学 (CFD) 模拟的面向对象 Python 框架。
请调用 `fluidsim` 技能对该二维湍流场执行伪谱法仿真。
用于材料科学计算和分析的 Python 库,支持结构分析和相图生成。
请调用 `pymatgen` 技能对该晶体结构执行对称性分析。
用于代谢网络约束重建和分析 (COBRA) 的 Python 库。
请调用 `cobrapy` 技能对该模型执行通量平衡分析 (FBA)。
天文学和天体物理学的核心 Python 库,提供坐标转换、时间尺度及 FITS 处理功能。
请调用 `astropy` 技能计算此天体的红移并转换坐标系。
用于高维数据降维和流形学习的 Uniform Manifold Approximation and Projection (UMAP) 算法实现。
请调用 `umap-learn` 技能对该高维数据集执行可视化降维。
由 Hugging Face 提供的 NLP、计算机视觉及多模态任务的最前沿机器学习模型库。
请调用 `transformers` 技能加载一个用于文本分类的预训练模型。
统计建模和计量经济学库,支持回归分析、时间序列预测和假设检验。
请调用 `statsmodels` 技能对该时间序列执行 ARIMA 模型拟合。
基于 PyTorch 的强化学习算法库,包含 PPO、SAC、DQN 等算法的高质量实现。
请调用 `stable-baselines3` 技能使用 PPO 算法训练一个控制智能体。
基于博弈论 Shapley 值的模型解释工具,用于评估特征对预测结果的影响。
请调用 `shap` 技能对该 XGBoost 模型的预测结果进行特征重要性可视化。
针对删失数据的生存分析和事件发生时间 (Time-to-event) 建模工具。
请调用 `scikit-survival` 技能对临床数据执行 Cox 比例风险模型分析。
业界标准的 Python 机器学习库,涵盖分类、回归、聚类和降维等经典算法。
请调用 `scikit-learn` 技能对该数据集执行随机森林分类。
用于模拟和分析开放量子系统动力学的 Python 开源软件库。
请调用 `qutip` 技能模拟该二能级系统在耗散环境下的演化。
由 IBM 开发的开源量子计算框架,用于编写、模拟和运行量子线路。
请调用 `qiskit` 技能编写一个实现 Bell 态的量子脚本。
跨平台的量子机器学习库,支持量子电路的可微编程与自动微分。
请调用 `pennylane` 技能构建一个变分量子电路 (VQC)。
🧪
PyTorch Lightning 深度学习框架
通过对 PyTorch 代码进行结构化封装来消除样板代码的深度学习高级框架。
请调用 `pytorch-lightning` 技能将该 PyTorch 模型改写为 LightningModule。
用于多目标优化问题的 Python 框架,支持多种进化算法和约束处理。
请调用 `pymoo` 技能解决这个带有约束条件的多目标优化问题。
用于贝叶斯统计建模和概率编程的 Python 库,支持复杂的采样算法。
请调用 `pymc` 技能构建一个贝叶斯层级模型进行数据推断。
高性能强化学习库,通过优化的向量化和多代理支持实现极速训练。
请调用 `pufferlib` 技能配置一个高性能的强化学习环境。
与 scikit-learn 兼容的时间序列机器学习 Python 工具包。
请调用 `aeon` 技能对这段时间序列数据执行异常检测。
云端实验室平台,用于高通量自动化蛋白质测试和验证。
请调用 `adaptyv` 技能在云端实验室提交蛋白质设计验证申请。
用于分析 Neuropixels 高密度神经电生理记录数据的综合工具包。
请调用 `neuropixels-analysis` 技能协助我处理该高密度神经信号数据集。
为各种临床专业生成简明扼要的 LaTeX/PDF 格式医学治疗方案。
请调用 `treatment-plans` 技能为该病例生成一份详细的治疗方案。
遵循既定标准和指南撰写全面的临床研究报告。
请调用 `clinical-reports` 技能协助我起草该二期临床试验报告。
为制药和临床研究生成专业的临床决策支持 (CDS) 文档。
请调用 `clinical-decision-support` 技能根据这些指南生成临床决策支持文档。
用于使用临床电子病历数据开发、测试和部署深度学习模型的医疗 AI 工具包。
请调用 `pyhealth` 技能基于 MIMIC-III 数据集构建患者再入院预测模型。
用于分析 ECG、EEG、EDA 等生理信号的综合 Python 工具包。
请调用 `neurokit2` 技能分析这段心电图 (ECG) 数据并提取特征。
用于读写及操作 DICOM 医学影像标准格式文件的 Python 包。
请调用 `pydicom` 技能提取该 CT 影像的元数据信息。
用于全切片图像分析、组织分割和病理数据机器学习的综合计算病理学工具库。
请调用 `pathml` 技能在该病理图像上执行肿瘤区域分割。
用于数字病理学整片图像 (WSI) 预处理、分割和分析的工具包。
请调用 `histolab` 技能自动提取 WSI 图像中的组织区域并切片。
用于蛋白质组学和代谢组学的综合质谱数据分析库,涵盖肽段鉴定及定量。
请调用 `pyopenms` 技能处理 LC-MS/MS 数据并鉴定肽段。
用于质谱数据处理和相似性匹配的库,支持 MGF/mzML 等多种格式及分子指纹比较。
请调用 `matchms` 技能对质谱数据进行过滤并计算 Cosine 相似度。
基于 PyTorch 的药物发现机器学习平台,包含 40+ 数据集及多种用于属性预测的 GNN 模型。
请调用 `torchdrug` 技能训练一个基于图形神经网络 (GNN) 的分子生成模型。
提供 Python API 的云端量子化学平台,用于自动化计算化学工作流。
请调用 `rowan` 技能提交该分子的几何优化计算任务。
用于分子信息学、机器学习及药物发现的核心开源化学信息学工具包。
请调用 `rdkit` 技能计算该分子的摩尔质量并生成 2D 图像。
提供对 Therapeutics Data Commons (TDC) 访问的 Python 库,包含用于药物发现的精选数据集和基准测试。
请调用 `pytdc` 技能从 TDC 检索 ADMET 基准测试数据。
提供超过 100 种分子特征化方法的 Python 库,用于将分子转换为机器学习可用的数值向量。
请调用 `molfeat` 技能为该化合物列表生成分子指纹。
用于药物化学分析和类药性评估的 Python 库。
请调用 `medchem` 技能评估该分子的 ADMET 属性和类药性。
基于扩散概率模型的蛋白质-配体对接工具,用于预测结合构象和亲和力。
请调用 `diffdock` 技能预测该配体与靶点蛋白的结合位置。
基于 TensorFlow 和 PyTorch 的分子机器学习与药物发现深度学习框架。
请调用 `deepchem` 技能训练一个化合物属性预测模型。
基于 RDKit 构建的分子操作与特征化库,简化了化学信息学工作流。
请调用 `datamol` 技能解析并清洗该化合物列表。
用于运行 Python 代码的无服务器云平台,专为 AI/ML 负载和科学计算优化。
请调用 `modal` 技能部署一个并行的分布式计算任务。
用于生命科学的开源数据框架,实现数据的可查询、可追溯及可重用性 (FAIR)。
请调用 `lamindb` 技能管理并追溯实验数据集。
用于单细胞多组学数据分析的概率深度学习架构和工具。
请调用 `scvi-tools` 技能执行批次效应校正和多组学整合。
基于 AnnData 的单细胞转录组分析全流程工具包。
请调用 `scanpy` 技能执行细胞降维和聚类可视化。
针对转录组 (RNA-seq) 批量数据的差异表达分析算法 Python 实现。
请调用 `pydeseq2` 技能对实验组和对照组进行差异基因筛选。
用于读写及操作 SAM/BAM/CRAM/VCF/BCF 等基因组比对与变异文件的 Python 包。
请调用 `pysam` 技能解析该比对结果文件并计算覆盖度。
基于 Rust 的高性能工具包,用于基因组区间分析、重叠检测及单细胞片段处理。
请调用 `gtars` 技能执行高性能的基因组区间重叠检测。
用于在 BED 文件(基因组区间)上构建无监督机器学习模型的工具包。
请调用 `geniml` 技能对这些 BED 文件进行向量化处理。
通过简单统一的接口高效查询基因组数据库的命令行工具和 Python 包。
请调用 `gget` 技能查询特定基因的参考序列。
用于查询和分析来自 CZ CELLxGENE Discover 项目的大规模单细胞 RNA-seq 数据的 Python 包。
请调用 `cellxgene-census` 技能检索特定细胞类型的基因表达谱。
提供对超过 40 个生物学 Web 服务和数据库进行统一访问的 Python 库。
请调用 `bioservices` 技能从 UniProt 检索信息。
用于计算生物学和生物信息学的核心 Python 库,提供序列操作和数据库访问功能。
请调用 `biopython` 技能解析该 FASTA 文件。
从单细胞 RNA-seq 数据中推断基因调控网络 (GRN) 的算法工具。
请调用 `arboreto` 技能推断该细胞样本的基因调控网络。
用于处理单细胞基因组学注释数据矩阵的 Python 库。
请调用 `anndata` 技能加载并分析单细胞表达矩阵文件。
用于使用 Python 访问 OMERO 显微成像数据管理系统的工具包。
请调用 `omero-integration` 技能获取显微成像数据集。
集成 Latch 平台,用于构建、部署和执行生物信息学工作流。
请调用 `latchbio-integration` 技能在 Latch 平台上运行分析任务。
用于编写和调试 Opentrons Python 协议 API v2 的工具包,实现实验室自动化。
请调用 `opentrons-integration` 技能协助我调试该自动化实验脚本。
用于在 DNAnexus 云平台上执行基因组学和生物医学数据分析的综合工具包。
请调用 `dnanexus-integration` 技能在该平台上提交一个分析作业。
用于编程式访问 Benchling 研发平台的工具包,涵盖序列、样品、库存及实验笔记管理。
请调用 `benchling-integration` 技能查询该 DNA 序列的详细元数据。
NIH 资助的代谢组学公共知识库,包含研究元数据、分析结果及质谱搜索工具。
请调用 `metabolomics-workbench` 技能查询该实验的研究元数据。
集成基因组、生物化学和系统功能信息的综合性数据库资源。
请调用 `kegg` 技能查找该代谢通路的相关图谱。
包含人类代谢物详细化学、生物学、疾病关联及生化通路的数据资源。
请调用 `hmdb-human-metabolome-database` 技能查询该代谢物的生理浓度和临床意义。
NHGRI-EBI 发布的基因组广泛关联研究目录,包含已证实的 SNP 与性状关联数据。
请调用 `gwas-catalog` 技能查询该单核苷酸多态性相关的性状。
NCBI 维护的高通量基因表达和功能基因组学公开数据库。
请调用 `geo-gene-expression-omnibus` 技能查询该实验的原始表达数据。
通过 openFDA 访问涉及药物、医疗器械和食品的安全及合规性数据库。
请调用 `fda-databases` 技能查询该药物的不良反应和标签信息。
提供超过 250 种脊椎动物基因组注释、序列和比较基因组学数据的数据库。
请调用 `ensembl` 技能查找该基因的序列和变异信息。
全面的核苷酸序列数据公开仓库,提供序列、组装和实验元数据访问。
请调用 `ena-european-nucleotide-archive` 技能搜索该物种的序列数据。
全面的生物信息学和化学信息学资源,包含药物结构、药理学及相互作用数据。
请调用 `drugbank` 技能查询该药物的药理特性和代谢通路。
癌症体细胞突变目录,全球最大的体细胞突变资源,包含变异特征及耐药数据。
请调用 `cosmic` 技能查询该肿瘤类型的常见突变。
全球最大的临床研究注册机构,提供全球临床试验的详细资料。
请调用 `clinicaltrials-gov` 技能查询该药物的相关临床试验进展。
NCBI 的人类基因变异及其临床意义公共库,提供标准化分类。
请调用 `clinvar` 技能查询该基因位点的临床相关性。
临床药物基因组学数据库,提供基因-药物相互作用、临床指南及药源注释。
请调用 `clinpgx` 技能查找该药物的基因组学用药建议。
由 EMBL-EBI 维护的手工策划的具有类药特性的生物活性分子数据库。
请调用 `chembl` 技能查询该化合物的生物活性数据。
全球最详尽的酶数据库,包含从科学文献中提取的详细酶数据。
请调用 `brenda` 技能查询该酶的催化活性和动力学参数。
访问来自 DeepMind 的超过 2 亿个高置信度蛋白质结构预测数据。
请调用 `alphafold-db` 技能查询特定蛋白质的结构预测。